Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms