Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RNF7Q9UBF6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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