Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TBCCD1Q9NVR7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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