Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms