Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms