Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS2Q9NRF8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms