Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms