Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms