Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms