Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf16Q9BUW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms