Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAGR1Q9BTK6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms