Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MESP1Q9BRJ9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MESP1Q9BRJ9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms