Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms