Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPIFA3Q9BQP9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms