Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC6Q99741 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC6Q99741 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms