Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms