Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms