Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms