Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms