Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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