Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms