Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms