Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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