Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms