Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms