Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP2Q8WWK9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP2Q8WWK9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms