Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms