Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNYL1Q8N7R7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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