Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms