Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms