Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP13Q86W25 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms