Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms