Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms