Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E7

TXNRD3NB, Protein TXNRD3NB, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3NBQ6F5E7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNRD3NBQ6F5E7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms