Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms