Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms