Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms