Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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