Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms