Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms