Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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