Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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