Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms