Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms