Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FAM107B-210ENST00000468492 625 ntTSL 45.78□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.662e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-205ENST00000414961 578 ntTSL 24.48□□□□□ -1.693e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-220ENST00000482277 549 ntTSL 43.13□□□□□ -1.912e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-222ENST00000488576 552 ntTSL 42.77□□□□□ -1.972e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-213ENST00000553027 4957 nt13.83□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-201ENST00000256680 725 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-210ENST00000551694 2661 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-205ENST00000546847 524 ntTSL 38.31□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FKBP11-209ENST00000551094 517 ntTSL 27.95□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.024e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 317.73■□□□□ 0.434e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.424e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.314e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.613e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.733e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.413e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.263e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 514.96□□□□□ -0.013e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-204ENST00000361997 3237 ntTSL 512.26□□□□□ -0.453e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PHF20L1-206ENST00000395376 2236 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-208ENST00000531989 1573 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-209ENST00000532052 3165 ntTSL 28.99□□□□□ -0.972e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DPF2-204ENST00000524666 4840 ntTSL 28.28□□□□□ -1.082e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-241ENST00000515749 829 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-232ENST00000511338 657 ntTSL 55.59□□□□□ -1.511e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.571e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.631e-46■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 416.41■□□□□ 0.228e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-222ENST00000531203 575 ntTSL 416.18■□□□□ 0.188e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-217ENST00000528270 588 ntTSL 415.77■□□□□ 0.128e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-212ENST00000486282 582 ntTSL 415.45■□□□□ 0.068e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 415.2■□□□□ 0.028e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-209ENST00000474459 814 ntTSL 414.92□□□□□ -0.028e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AMPD2-206ENST00000459643 550 ntTSL 413.63□□□□□ -0.238e-8■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 MKL2-208ENST00000573434 466 ntTSL 37.78□□□□□ -1.166e-12■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SPHK2-207ENST00000598574 1786 nt14.8□□□□□ -0.044e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 HPN-205ENST00000596662 584 ntTSL 414.58□□□□□ -0.083e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.952e-8■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 NF1-208ENST00000471572 2028 ntTSL 27.67□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 LINC00511-207ENST00000580175 436 ntTSL 37.11□□□□□ -1.274e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.237e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.17e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-208ENST00000603795 1166 ntTSL 319.17■□□□□ 0.667e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.027e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.297e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-205ENST00000603296 405 ntTSL 311.86□□□□□ -0.517e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-207ENST00000603726 587 ntTSL 511.86□□□□□ -0.517e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-209ENST00000603881 465 ntTSL 311.62□□□□□ -0.557e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SELENOW-214ENST00000601937 674 ntTSL 29.38□□□□□ -0.911e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SELENOW-215ENST00000602163 2503 nt9.28□□□□□ -0.921e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 28.75□□□□□ -1.011e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-203ENST00000603005 352 ntTSL 37.98□□□□□ -1.137e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.297e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.582e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 219.02■□□□□ 0.647e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.587e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.57e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.347e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.047e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-8■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 57.94□□□□□ -1.142e-8■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 UCKL1-204ENST00000430743 888 ntTSL 312.6□□□□□ -0.391e-12■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 220.53■□□□□ 0.885e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.715e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 318.33■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 PROC-209ENST00000464089 563 ntTSL 416.13■□□□□ 0.176e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-6■■■□□ 17.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 194.6 ms