Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms