Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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