Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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