Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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