Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRSQ13332 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRSQ13332 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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